新聞動(dòng)態(tài)
酰胺鍵的構(gòu)建廣泛存在于藥物活性分子、天然產(chǎn)物和生物大分子的合成中。因此,高效可靠的多肽縮合試劑在有機(jī)合成中至關(guān)重要。到目前為止,已開(kāi)發(fā)出多種類(lèi)型的多肽縮合試劑,并不斷拓展其應(yīng)用范圍,以應(yīng)對(duì)復(fù)雜多樣的分子結(jié)構(gòu)需求。其中,TCFH-NMI組合便是一種“老樹(shù)新枝”的代表,該組合最初是用于含有手性中心的羧酸和非活性胺的酰胺化反應(yīng),通過(guò)在反應(yīng)中原位生成高反應(yīng)性的N-?;溥蜴f鹽驅(qū)動(dòng)反應(yīng)的進(jìn)行(見(jiàn)下圖1),不僅具有優(yōu)異的立體選擇性,也實(shí)現(xiàn)了公斤級(jí)規(guī)模的生產(chǎn)(詳見(jiàn)高效酸胺縮合的黃金組合:TCFH-NMI)。

圖1
武田公司的一項(xiàng)研究顯示,在含水溶劑中使用TCFH-NMI組合能以高收率得到酰胺產(chǎn)物,揭示了該組合在含水溶劑中的應(yīng)用潛力?;诖?,百時(shí)美施貴寶公司進(jìn)行了更深層次的研究:以水為主要反應(yīng)介質(zhì)的條件下,探索TCFH-NMI酰胺化的適用范圍和適用條件。
該公司針對(duì)TCFH-NMI組合在含水介質(zhì)中的應(yīng)用,探索并確立了通用操作步驟:將酸(500 mg, 1.0 eq)置于20 mL反應(yīng)瓶中,依次加入含水溶劑(水:85%,有機(jī)溶劑:四氫呋喃/乙腈/丙酮,15%)、胺(1.1-1.3 eq)和NMI(3.5 eq),最后分三批加入TCFH(3*0.5 eq),批次間隔為10分鐘,加完后反應(yīng)30 min。
1. 溶劑影響
含水量影響:反應(yīng)通常在85%的含水量下進(jìn)行,對(duì)部分化合物而言,在含水量≤50%時(shí),隨含水量的增加,反應(yīng)轉(zhuǎn)化率降低;而當(dāng)含水量超過(guò)85%時(shí),反應(yīng)轉(zhuǎn)化率跟純乙腈作溶劑時(shí)相當(dāng)。
有機(jī)溶劑的選擇:丙酮,四氫呋喃和乙腈可相互替代,其中丙酮作為共溶劑效果更優(yōu),其他水溶性有機(jī)試劑也可嘗試,占比為15%。
2. 堿的用量
NMI當(dāng)量(2.1和3.5 eq)對(duì)轉(zhuǎn)化率和差向異構(gòu)化均無(wú)顯著影響。
Richard J. Fox和Dung L. Golden等人用武田制藥公布的方法嘗試合成一個(gè)腫瘤藥物中間體(見(jiàn)下圖2),但轉(zhuǎn)化率低于40%,即使更改有機(jī)溶劑和添加表面活性劑也無(wú)顯著改善,推測(cè)歸因于異丙胺的空間位阻效應(yīng),改用位阻較小的胺(如苯胺衍生物)后,轉(zhuǎn)化率顯著提高。

圖2
因而,該團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步對(duì)多種胺類(lèi)化合物和羧酸進(jìn)行了系統(tǒng)實(shí)驗(yàn),總結(jié)了以下規(guī)律:
1. 胺類(lèi)化合物
在水溶液中采用TCFH-NMI進(jìn)行縮合反應(yīng),底物位阻越大,反應(yīng)轉(zhuǎn)化率越低。通過(guò)對(duì)20種胺類(lèi)化合物與4種羧酸進(jìn)行酰胺化的試驗(yàn)(見(jiàn)下圖3),得出以下規(guī)律:
芳香胺:含有弱吸電子基和給電子基轉(zhuǎn)化率都很高;含強(qiáng)吸電子基則轉(zhuǎn)化率較低;
脂肪胺:適用于強(qiáng)親核性胺。

圖3
另外,當(dāng)使用氨作為反應(yīng)底物時(shí),含水條件下(85%水)反應(yīng)效果較差,可能與氨在水中會(huì)形成氫鍵,導(dǎo)致其親核性降低有關(guān),當(dāng)乙腈和水占比相當(dāng)時(shí),轉(zhuǎn)化率明顯提升。
2. 羧酸
除了空間位阻同胺類(lèi)化合物一樣,會(huì)對(duì)反應(yīng)產(chǎn)生負(fù)面影響外,羧酸的pKa和取代基的電子效應(yīng)亦是影響反應(yīng)結(jié)果的關(guān)鍵因素。
pKa
在pKa 3.0-5.0的范圍內(nèi),基本遵循pKa值越大,反應(yīng)效果越好,其中在3.8-5.0范圍內(nèi),轉(zhuǎn)化率可達(dá)90%以上(見(jiàn)圖4)。

圖4
電子效應(yīng)
通過(guò)對(duì)23種不同的羧酸與芐胺反應(yīng)進(jìn)行Hammett式研究,結(jié)果顯示:
取代基為中等電子取代基(包括吸電子和給電子)和中性取代基時(shí),轉(zhuǎn)化率最高(>80%);為強(qiáng)吸電子取代基時(shí),轉(zhuǎn)化率稍低(60-80%);為強(qiáng)給電子取代基時(shí),反應(yīng)轉(zhuǎn)化率很差(<40%)。
優(yōu)秀的縮合試劑或反應(yīng)體系,需同時(shí)兼顧高反應(yīng)效率和優(yōu)異的立體選擇性,該團(tuán)隊(duì)以芐胺與不同的氨基酸和肽進(jìn)行差向異構(gòu)化實(shí)驗(yàn),其中N-Boc-苯丙氨酸和N-Boc-苯甘氨酸均取得了優(yōu)異的轉(zhuǎn)化率以及er(對(duì)映體比率)值>99.9:0.1。然而,二肽與不同的胺進(jìn)行測(cè)試時(shí),er值卻很差,猜測(cè)是因?yàn)槎脑诜磻?yīng)過(guò)程中形成了易被消旋的噁唑酮中間體。
1. 克級(jí)規(guī)模
該團(tuán)隊(duì)不僅對(duì)篩選反應(yīng)底物進(jìn)行了大量實(shí)驗(yàn),還進(jìn)行了克級(jí)規(guī)模的放大,在丙酮/水=15%/85%體系中,進(jìn)行五組不同的羧酸和胺類(lèi)化合物的反應(yīng),所得產(chǎn)物純度高,且過(guò)程質(zhì)量強(qiáng)度(PMI)遠(yuǎn)低于行業(yè)平均值,生產(chǎn)效率高,展現(xiàn)出很好的生產(chǎn)潛力。
2. 活性分子合成
為進(jìn)一步驗(yàn)證該試劑在含水體系中的應(yīng)用價(jià)值,此團(tuán)隊(duì)將該體系應(yīng)用于Linrodostat,奧拉帕尼,利伐沙班類(lèi)似物,尼洛替尼,伊馬替尼等活性分子的合成, 除了尼洛替尼因反應(yīng)底物溶解度差,體系粘稠等原因?qū)е滦Ч钔猓溆嗑褍?yōu)異的收率和純度得到目標(biāo)化合物。
文章開(kāi)頭提到了TCFH-NMI的作用機(jī)制是通過(guò)形成活性N-?;溥蜴f鹽,促進(jìn)反應(yīng)的進(jìn)行。而在含水體系中,此組合的反應(yīng)效率取決于反應(yīng)路徑即生成N-?;溥蜴f鹽和非反應(yīng)水解路徑的平衡(見(jiàn)下圖5),當(dāng)羧酸存在強(qiáng)吸電子基團(tuán)或強(qiáng)給電子基團(tuán)、胺類(lèi)化合物含有很弱的給電子基團(tuán),以及兩者位阻較大時(shí)均會(huì)降低反應(yīng)路徑的速率,從而使非反應(yīng)路徑的占比提高,降低產(chǎn)物的收率。

圖5
該團(tuán)隊(duì)還開(kāi)發(fā)了監(jiān)督機(jī)器學(xué)習(xí)模型來(lái)預(yù)測(cè)TCFH-NMI組合在含水體系中進(jìn)行酰胺化反應(yīng)的轉(zhuǎn)化率,包括羧酸和胺的立體和電子特性,通過(guò)交叉驗(yàn)證和獨(dú)立驗(yàn)證集評(píng)估模型的預(yù)測(cè)性能。結(jié)果表明,該模型在預(yù)測(cè)此組合酰胺化轉(zhuǎn)化率方面表現(xiàn)良好。
總的來(lái)說(shuō),該團(tuán)隊(duì)研究了超過(guò)100例使用水作為主要反應(yīng)溶劑的TCFH-NMI酰胺化案例,綜合數(shù)據(jù)表明,這種組合在含水體系中是可行的,且在許多情況下可以高效、可直接分離得到產(chǎn)物,但該反應(yīng)體系并非是一個(gè)適用于所有底物組合的解決方案。盡管如此,但該項(xiàng)工作為推動(dòng)水相縮合反應(yīng)及其他有機(jī)反應(yīng)在含水介質(zhì)中的應(yīng)用提供了借鑒和啟發(fā)。
蘇州昊帆生物股份有限公司(股票代碼:301393.SZ),成立于2003年,總部位于蘇州市高新區(qū),是一家為全球醫(yī)藥研發(fā)及生產(chǎn)企業(yè)提供特色原料的國(guó)家高新技術(shù)企業(yè)。產(chǎn)品主要應(yīng)用于多肽、核苷酸和醫(yī)藥合成等領(lǐng)域,產(chǎn)品范圍涵蓋特色酰胺鍵構(gòu)成用縮合劑、保護(hù)劑、鏈接劑、抗體偶聯(lián)藥物用蛋白質(zhì)交聯(lián)劑、分子砌塊、脂質(zhì)體、磷試劑等種類(lèi)。目前已累計(jì)研發(fā)生產(chǎn)各類(lèi)產(chǎn)品達(dá)1500多種。
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參考文獻(xiàn):
[1] Fox, R. J.; Golden, D. L.; Chartrand, C. C., et al. Tetramethylchloroformamidinium Hexafluorophosphate?N?Methylimidazole Amidation in Water: Successes, Limitations, and a Regression Model for Prediction [J]. Org. Process Res. Dev., 2025.
